二次感染通常是指机体再次感染病毒、细菌等致病微生物，或者应用抗生素时间较长、使用过量，导致机体正常菌群失调，再次引发感染。
对于新型冠状病毒感染，感染后通常在3-6个月之内较少发生重复感染。但是期间有可能感染相关病毒的变异病种，或者是感染其他病毒的人群接触，进而引发二次感染。此外，新型冠状病毒感染者如果继发细菌感染，使用抗生素治疗，如果不规范用药可能会发生敏感菌群感染，故应注意避免私自使用抗生素类药物。
对于需要长期或大量使用抗生素的人群，应积极注意预防二次感染的发生，如注意身体卫生护理、伤口管理、环境卫生消毒等，尤其是要注意补充营养，提高体质，尽可能避免发生二次感染。发生二次感染后原先使用的抗生素通常对机体的致病菌没有较大作用，应积极配合医生调整治疗方案。
通常在感染新型冠状病毒期间，积极处理多不会继发细菌感染，但如果自身存在基础疾病、平时体质较差、生活环境较差等人群，发生继发细菌感染的可能性较大，应多加关注。