避孕药偶尔吃一次对身体的危害一般较小，特别是短效或长效避孕药，但对于服用紧急避孕药的女性，可能出现月经失调、阴道流血、类早孕反应等，随着药物在体内代谢以后，通常会恢复到正常。
女性服用避孕药是临床较常见的避孕方法，主要是避孕药中含有的雌激素、孕激素，可以抑制排卵或改变子宫颈黏液的粘稠度，避免精子与卵子结合而达到避孕的目的。如果女性服用的是短效或长效避孕药，因为药物含有的激素成分较少，刺激性也较小，偶尔吃一次一般不会造成较为明显危害，部分女性可能因药物对胃肠道造成刺激及而出现胃痛、胃酸等不适，因为药物在体内代谢需要一定的时间，如果出现不适症状，当药物代谢完毕以后，就会恢复到正常水平，不会有太大的影响，所以对身体的危害性并不是很大。
如果只是偶尔吃一次紧急避孕药，如左炔诺孕酮片、左炔诺孕酮肠溶片等，因为其中含有的激素较多，可能影响体内激素平衡，部分女性可能会出现月经紊乱的情况，如月经提前、月经推后，也有部分女性在停药后因子宫内膜失去过高的雌激素支持而脱落，出现阴道流血，属于子宫内膜撤退性出血，可能出现恶心、呕吐等类似怀孕初期的症状，通常无需治疗。一般不建议使用长效或紧急避孕药作为常规避孕方法，如果女性长期没有生育的打算，可以选择其他的方式进行避孕，如佩戴避孕套或使用宫内节育器等，对身体的伤害相对较小。
女性要注意在服用紧急避孕药时需要在性生活72小时内口服，如果超过了72小时，其避孕效果较差，可能会起不到避孕的作用。如果女性使用避孕药后出现停经，需前往医院妇科就诊，完善腹部超声、血HCG检查等，以明确是否怀孕。