水蛭素一般情况下能溶解血栓，但在应用时也需要医生指导，结合个人病情与体质选择合适的剂量进行使用，不可盲目或私自乱用。
水蛭素主要原材料为水蛭唾液，是经过特殊加工从水蛭的唾液中提取出的有效活性成分，经过临床研究发现水蛭素对于凝血酶有一定的抑制作用。由于凝血酶属于一种丝氨酸蛋白酶，在血栓的形成过程中起到着关键的作用，水蛭素对于此成分具有一定的抑制作用，应用后可以达到预防血栓和溶解血栓的作用，临床上可被应用于治疗和预防各种血栓形成。
临床上通过动物实验表明，水蛭素能够高效的抗凝血作用，起到抗血栓形成的效果，临床上可被应用于急性心肌梗死溶栓治疗的辅助用药，也可被应用于血管内凝血症状的治疗中，临床上应用较为广泛，并且药效发挥作用较快，但具体使用剂量需由医生判断。
水蛭素虽然应用后具有抗血栓治疗的作用，出血副作用也比较小，但在应用时也应注意，对于此药物成分过敏的人群应禁用，以免出现过敏反应。如果患者使用水蛭素后出现消化道出血、皮肤黏膜自发性瘀斑、牙龈出血、腹胀、恶心、过敏等症状，建议及时前往医院内科就诊，进行视诊、触诊、血常规、凝血四项等检查，在医生指导下使用进行治疗。