朱砂通常可以放在枕头下，并不会对身体健康造成明显伤害，但也不会有治疗效果。如果存在治疗需求，建议到医院就诊，在医生的指导下正确用药。
朱砂属于一味重金属药物，味甘，性微寒，归心经，可以起到定惊、安神、明目等功效，适用于治疗心神不宁、心悸、失眠、惊癫、视物昏花等。此外，朱砂也能清热解毒，多用于缓解咽喉肿痛、疮疡肿毒、口舌生疮等。如果出现上述药物适应证，可以到医院内科就诊，由医生辨证后遵医嘱服用相应剂量的朱砂，通常冲服或入丸剂、散剂等治疗疾病，不宜入煎剂，并且放在枕头下也无较好治疗效果。
由于朱砂成分为硫化汞，含有微量杂质，可被吸收入血，与肾、肝、心脏等组织中的含基蛋白酶结合，降低酶蛋白功能，对细胞正常代谢产生影响。因此，若长期或大量服用，可能会造成中毒，出现腹痛、呕吐、腹泻，严重者出现少尿、无尿及昏迷等，通常不能自行使用朱砂。但是由于朱砂放在枕头下未长期与皮肤接触，也没有服用，所以通常不会对人体产生较大危害，可以放在枕头底下，此时应注意不要让朱砂漏出。
由于朱砂放在枕头底下无治疗作用，并且如果朱砂漏出，身体长期接触还有中毒的风险，因此，不建议将朱砂放在枕头底下。而如果有身体不适，建议到医院就诊治疗。