在控制好进食量的前提下，长期适量喝胶原蛋白肽通常不会对自身产生危害，还能为自身提供营养、能量，无需过于担忧。不过若长期大量喝胶原蛋白肽，可能会引起胃肠道不适、过敏等危害。
1、脾胃不适：胶原蛋白肽为蛋白质的一种，多为动物皮、骨骼等组织内的胶原蛋白通过水解而做成的。胶原蛋白肽的结构较为稳定，身体的吸收率也不算高，长期吃虽不会引发肥胖问题，但若频繁、大量喝胶原蛋白肽，常会让胃部消化负担变大，较易继发消化不良，如胃疼、食欲变差、反酸、恶心等异常现象。
2、过敏：若个人为过敏体质，不论是长期喝还是喝一点，均易继发变态反应，使皮肤发生红斑、肿胀、皮疹，还有气促、喘息等异常现象，对皮肤以及自身健康不利。
3、肝肾负担变大：胶原蛋白肽在被摄入到身体中后多会经肝肾代谢，若吃的是不合规的胶原蛋白肽，还不控制好进食量，多会让肝肾负担变大或功能受损，也许会发生水肿、黄疸等异常现象。
应在医生指导下选择正规厂家生产的胶原蛋白肽，并遵医嘱按量应用。平日若合理进食鸡蛋、鱼肉、猪肉、豆腐等高蛋白类食物，营养摄 入充足，无需额外喝胶原蛋白肽，以防摄入过多而危害个人健康。