水烧两次一般来讲是没有安全问题的，也不会对机体健康造成伤害。但是如果水一直重复烧，可能会形成危害人体的物质。
水烧开放凉后再重新烧开，仅是煮沸一两次，且煮水的器具较为干净，烧开的水内也无病原体、尘土等有害物质，此时适当喝烧开两次的水，通常对自身健康不会有明显损害，还能减轻口渴、咽干等现象，无需过于担忧。
但因为水中包含钙、铁、铜等离子元素，水烧两次且每次水烧开的时间过长，容易让水中的离子析出。若频繁喝此类水，可能会让脾胃消化、肝肾排泄负担变大，从而让肝脏、肾脏、胃肠等处发生结石的风险增加。
另外，水内常包含硝酸盐，若频繁喝这样的水，可能会让该类物质变为亚硝酸盐，具有一定致癌性。虽然含量很低，但若长期大量喝，也容易造成堆积，从而增加罹患食管癌、肝癌等疾病的概率，对身体有一定伤害。
日常烧水的工具应注意勤清洗，以防长期不清洁导致器具内部生成水垢。由于水垢处较容易聚集细菌或有害物质，在烧水期间也可能会掉落在水中，不仅干扰水的口感，喝了以后还可能会引发胃疼、拉肚子等不良现象，甚至还会继发急性胃肠炎。
平日应避免频繁将水烧开，避免喝生水或喝未烧开的水，以防刺激胃肠内组织。对于烧开的水应及时喝掉，并盖好盖子，以防尘土或昆虫等掉落水中将水污染。