长期吸入布地奈德的危害包括引起口咽部病症、呼吸系统病症、免疫系统病症、内分泌病症等，患者在应用布地奈德时应谨遵医嘱，不可盲目使用。
1、口咽部病症：布地奈德属于肾上腺皮质激素药物，具有较强的局部抗炎作用，并且也可有效预防运动诱发的支气管收缩，临床上可被应用于支气管哮喘的治疗。但是如果长期使用药物，药效在发挥作用的同时糖皮质激素类药物成分也会沉积在口腔部位，此时容易导致口腔部位及咽喉部位的抵抗能力下降，可能会增加感染真菌的风险，从而出现口咽部病症，如口炎、咽炎、喉炎等。
2、呼吸系统病症：由于此药物属于激素类药物，如果长期使用，可能会对呼吸道黏膜造成刺激，使呼吸道黏膜出现充血甚至肿胀现象，容易使患者出现声音沙哑、咳嗽等呼吸系统症状。
3、免疫系统病症：布地奈德在使用时会抑制免疫功能，并且容易降低局部黏膜抵抗能力，若长期使用还有可能会使机体出现免疫功能低下，从而引起超敏反应。
4、内分泌病症：长期使用该药物，还有可能会使机体出现肾上腺皮质激素增多，导致肾上腺皮质机能亢进，使患者出现满月脸、水牛背、向心性肥胖等症状。
患者在吸入用布地奈德期间，建议在医生的指导下使用，不可以擅自延长药物使用时间或增减药量，如果出现不适症状，建议及时停药就医。