揉眼睛会痛有可能是过度疲劳导致，还有可能是青光眼、过敏等原因导致。建议患者在医生的指导下，进行针对性治疗。
1、过度疲劳：如果患者最近睡眠不足、用眼时间过久等，就有可能会导致眼睛过度疲劳，局部睫状肌出现痉挛状态，而且睑板腺分泌功能也会出现障碍，就有可能使眼表部位的润滑度降低，出现眼睛干涩以及压痛的情况，从而导致揉眼睛会疼。建议患者注意用眼，避免用眼过度，可控制使用手机等电子产品的时间，同时可做眼保健操，缓解眼疲劳。
2、青光眼：如果患者出现青光眼的情况，会导致眼内压力升高，对眼内的血管以及神经都会造成压迫，而且眼球还会出现胀痛的情况，如果这时揉眼睛，就会出现疼痛，甚至还有可能会导致患者并发头痛症状。患者可使用硝酸毛果芸香碱滴眼液等药物进行治疗。
3、过敏：是指机体在接触外界物质后，如花粉等，产生的一种变态反应，如果患者的眼皮接触到致敏物质，产生过敏反应，就有可能会导致局部出现炎性反应，炎症刺激会使患者出现眼睛肿胀、压痛等情况，所以在揉眼睛的时候会痛。患者可在医生指导下使用药物进行治疗，如盐酸苯海拉明片等。
4、其他原因：如果患者本身就患有结膜炎、睑腺炎、角膜炎、浅层巩膜炎、视神经炎、虹膜炎等局部炎症性病变，就有可能会导致局部黏膜出现充血、水肿的情况，而且黏膜下的毛细血管也会处于扩张状态，有可能会造成按压痛，导致患者揉眼睛时会痛。患者可遵医嘱使用氟米龙滴眼液等药物治疗。
揉眼睛会疼的患者，可及时到医院眼科就诊，由医生进行视诊、眼底镜等检查，明确具体的病情。