金针菇没熟的情况下，过量食用可能会导致中毒。金针菇中含有一定量的秋水仙碱成分，如摄入过多，可能会对胃肠黏膜产生一定刺激，引起恶心、呕吐、腹痛等不适，严重时还可能导致中毒。
通常新鲜金针菇中含有秋水仙碱成分，直接摄入会刺激胃肠道黏膜及呼吸道黏膜，而该成分经过水煮等烹制方法后可被分解，所以金针菇充分烹制熟透后可放心食用。但若食用未熟的金针菇，可能会导致机体摄入一定量的秋水仙碱，摄入量较少时可能会出现腹泻、腹痛、恶心等不适；摄入量过多时，可能会出现较明显的机体不适症状，如发烧、呕吐、腹泻、电解质紊乱、代谢性酸中毒等，严重影响身体健康。
对于少量误食未熟金针菇的人群，建议增加饮水量，或进行适当催吐，促进机体代谢，帮助有害物质排出。而对于引起明显不适症状的人群，则需及时前往医院急诊进行洗胃处理，同时遵医嘱服用诺氟沙星胶囊、蒙脱石散、奥美拉唑肠溶片等药物，控制感染、缓解腹泻等症状，降低对身体的伤害。
金针菇中还含有大量膳食纤维，食用没熟的金针菇后还可能诱发消化不良等不适反应。对于肠胃功能较差的人群更应减少食用金针菇，以免增加胃肠道消化负担，另外日常饮食需将食物完全烹饪熟透后食用，避免引起食物中毒等不良后果。