多囊肾和肾囊肿的区别主要在于病因不同、影像表现不同、临床症状不同、治疗方法不同，以及预后不同。建议多囊肾和肾囊肿的患者明确诊断后，在医生指导下进行针对性处理。
1、病因不同：多囊肾是指双肾多个肾小管节段或肾小球囊进行性扩张，形成多个液性囊肿，并最终导致不同程度肾功能损害的一类遗传性肾脏疾病，一般为家族显性遗传性疾病。肾囊肿是一侧或双侧肾脏出现单发或多发、大小不等且与外界不相通的囊性结构，病因尚不明确，可能与遗传、肾脏疾病及透析治疗等因素有关。
2、影像表现不同：多囊肾一般双肾均可累及，特点是肾脏正常结构破坏或者消失殆尽，并被大小不一的囊肿所替代，肾脏体积可能会明显增大。肾囊肿一般累及单侧，多零星分布，且囊肿通常比较小。
3、临床症状不同：多囊肾患者临床症状主要包括血压升高、腰痛、腹痛、血尿、腹部包块，以及肾功能不全。如果婴儿存在多囊肾，可表现为出生时肝肾明显肿大、腹胀，常伴有贫血、高血压、生长发育不良的情况。多数肾囊肿的患者无明显临床症状，常在超声体检中发现，但也有少数患者会存在腹部及腰背部疼痛、尿频、血尿、蛋白尿、脓尿、高热、腹部包块等现象。
4、治疗方法不同：多囊肾的患者可遵医嘱使用贝那普利、缬沙坦、替米沙坦等药物治疗，对于疼痛严重、药物治疗不佳者，可考虑囊肿穿刺硬化治疗、囊肿去顶减压术甚至肾脏切除术。如果出现肾衰竭并进展至终末阶段，则患者需采取替代治疗，如血液透析、腹膜透析、肾移植等。如果肾囊肿的患者囊肿较小，比如未超过4cm，且无明显症状，则可暂时观察，如果囊肿较大，比如已超过4出门，且症状明显，则需通过腹腔镜去顶减压术、腹腔镜下囊肿切除手术、开腹肾切除术等手术治疗。
5、预后不同：多囊肾的患者易随疾病发展出现肾衰竭，或到达尿毒症期，且由于目前无有效的干预措施和治疗药物，因此只能对症治疗延缓疾病进展。由于肾囊肿对肾功能影响较小，因此患者一般预后较好，不影响寿命。
建议怀疑存在多囊肾和肾囊肿的人，去往医院的肾内科或泌尿外科就诊，完善尿常规检查、超声检查、CT检查、磁共振成像检查等，以明确诊断。对于囊肿较大的患者而言，应避免剧烈的体力活动和腹部受创，以免囊肿破裂出血。