肝内胆管和肝外胆管在位置、结构上有所区别，具体如下：

位置

肝内胆管位于肝脏内，左右肝叶内；肝外胆管位于肝门外，与肝脏相邻，与肝内胆管相接，终端开口于十二指肠。

结构

肝内胆管有多个分支，呈根系样，包括毛细胆管、小叶间胆管等；肝外胆管分上下两段，胆囊管以上称肝总管，胆囊管以下称胆总管，与门脉平行形成双管结构，包括肝左管、肝右管、肝总管、胆总管。

肝内胆管与肝外胆管均为胆管，其主要功能为汇聚和容纳胆汁，是胆汁的输送管道，导管有括约肌，使胆汁以单程方向流入十二指肠。