苯丙酮尿症患者可出现头发颜色改变，由黑色逐渐变为棕色或黄色，同时皮肤和虹膜颜色也会受到影响。

正常情况下，体内的苯丙酮酸会经过酶的作用被分解和排出体外。然而，苯丙酮尿症患者缺乏酶的活性，导致苯丙酮酸无法被正常代谢和排泄。苯丙酮酸在体内积聚过多后，会进入到血液循环中，并最终沉积在皮肤、毛发和其他组织中。在头发中，苯丙酮酸与毛发中的蛋白质结合，会导致头发呈现棕黄色。

治疗苯丙酮尿症头发棕黄色主要通过饮食疗法实施。饮食限制苯丙氨酸及其代谢产物的摄入，减少体内苯丙酮酸的积累，从而减轻或改善头发棕黄色。治疗方案包括低苯丙氨酸蛋白质摄入、限制酪氨酸和苯丙酮酸的含量，以及补充含有必要营养素的特殊配方食物。此外，通常需要终身遵循低苯丙氨酸饮食，根据年龄和个体情况进行定期监测和调整。