肛周脓肿早期主要症状为肛周突然剧烈疼痛，红肿发热，坐卧不安，全身感染性症状不明显。多由肛腺感染经外括约肌皮下部向外扩散而成。常位于肛门后方或侧方皮下部，一般不大。病变处明显红肿，有硬结和压痛，脓肿形成可有波动感，穿刺时抽出脓液。

直肠肛管周围间隙为疏松的脂肪结缔组织，感染极易蔓延、扩散。由隐窝炎发展成肛腺炎，经括约肌间感染，形成肛管直肠周围炎，通过腺体的管状分支，或沿联合纵肌走形向上、下、外三个方向在直肠肛管周围形成不同部位的脓肿。其中感染向下达肛周皮下，形成肛周脓肿。

临床医生一般以局部检查为主，视诊观察局部脓液及皮肤状态；指诊了解脓肿地形态、性质。内镜检查直肠内有无内口、脓血及其他病变。直肠腔内超声检查，超声显像脓肿多表现为肛管直肠周围软组织内低回声或液性暗区，为圆形或椭圆形，亦有不规则形，边界模糊不清，后壁回声稍强。其中超声显示不均匀低回声型，为脓肿早期。

早期的肛周脓肿或无条件手术时可采用非手术治疗法，可以缓解症状，减轻患者痛苦，但非手术治疗并没有处理内口，其所称的治愈仅仅是局部脓肿地红肿暂时消退及临床症状的暂时好转。因此，非手术治疗不易单独使用，应当根据医生诊断结合手术疗法。可在医生指导下口服缓泻剂或液状石蜡以减轻排便时疼痛。