阴茎上长黑色的斑除了与老年斑、色素沉着等生理因素有关外，应考虑色素痣。色素痣在临床表现为出生就有或在出生后逐渐出现，20岁前基本全部显现，可发生于阴茎，一般呈单发或多发，面积或大或小，呈黄褐、瓦青、淡蓝、灰黑、漆黑色等，因此可有阴茎上长黑色斑的情况。黑斑扁平或突出于皮肤表面，与周围正常组织的界限清晰或模糊，有些还可长有毛发，又称黑毛痣，一般比较稳定或生长缓慢。

色素痣细胞起源于神经嵴，是类似表皮细胞的多角形或卵圆形细胞，细胞内含有黑色素颗粒，有一个卵圆形的细胞核，往往密集成细胞巢，逐渐移行至皮肤的表面，从而形成色素痣。

色素痣的治疗原则为改善外观并防止恶变，治疗方法包括手术治疗和非手术治疗。任何类型的色素痣均可手术切除并进行病理检查，可采取切除缝合法、切除植皮法，需根据病变大小决定。此外，也可采取冷冻、激光、化学剥脱法等物理疗法进行治疗。