牙根分叉是牙齿发育的其中一个环节，是由于上皮根鞘的生长不同所致。上皮隔发出舌样突起，与对侧的舌样突起接触并相互融合，将牙根主干的原始单一开孔分成两到三个孔，每个孔的上皮根鞘围绕开孔以相同速度生长，牙根延长。舌样突起融合形成上皮桥，即将来的根分叉区。上皮桥将诱导根分叉区成牙本质细胞的分化和牙本质的形成。

牙根分叉及发育一直持续至牙萌出至口腔后一段时间才完成，它的发育取决于上皮根鞘、牙乳头和牙囊细胞的相互作用，是牙发育的最后阶段，不仅形成生理性牙根，还涉及牙骨质形成和牙周膜形成。通过根分叉区了解牙根数目与形态，对临床牙髓病与根尖周病治疗后的牙体修复有重要意义。