含牙囊肿和萌出囊肿是处于牙齿萌出不同阶段的囊肿，含牙囊肿是处于未萌出的牙颈部囊肿，一般肉眼不可见，多通过X线确诊，可出现病牙根部有阴影，呈圆形或椭圆形的透射区，边缘清晰整齐。

萌出囊肿是覆盖在正在萌出的乳牙上，或者恒牙牙冠表面的软组织内的囊肿。肉眼可见囊肿形成的血疱，并表面光滑，质软，且具有一定的波动感，可呈半透明、蓝色或棕紫色。

含牙囊肿和萌出囊肿的治疗有所区别，具体如下：

• 含牙囊肿：多采用开窗法，切除部分囊壁，使囊腔与口腔相通，随着囊液的排出，消除了囊肿对周围组织结构的压力，囊肿会缩小，牙可自然萌出，有时可辅助使用一些负压装置帮助囊液排出。如果是多生牙的含牙囊肿，则采取手术，连同囊内牙一并摘除。

• 萌出囊肿：通常在牙齿萌出后自发破裂，因此不需要任何治疗，除非出现继发感染或导致下方的牙不能萌出或萌出延迟。如出现这些情况，最常用的方法是切除部分表面黏膜和囊肿的顶部以加快牙齿萌出。