木耳虽有营养价值，但也可能引发过敏反应，如皮肤瘙痒、红肿等，应避免食用以防过敏。其富含的纤维素可能导致胃肠不适，对于胃肠功能弱者需适量食用。此外，木耳可能增加白内障风险，已有眼部疾病者应控制摄入量。慢性肠炎患者食用木耳需谨慎，因其可加重症状。
1、过敏体质：某些人对木耳中的某些成分可能存在过敏反应，如皮肤瘙痒、红肿、呼吸困难等。如果之前曾经出现过类似症状，建议避免食用木耳，以防再次引发过敏反应。
2、胃肠不适：木耳中含有一定量的纤维素，过量食用可能导致胃肠不适，如腹胀、腹痛等，对于胃肠功能较弱的人群，应适量食用木耳，避免过量。
3、眼部疾病：木耳中的某些成分过量摄入可能会对眼部健康造成影响，如增加白内障的风险，已经有眼部疾病的人应适量食用木耳，避免过量。
4、慢性肠炎：木耳含有较多的膳食纤维，可能会加重慢性肠炎患者的症状，如胀气、腹泻等，慢性肠炎患者应谨慎食用木耳。
5、出血倾向或凝血机制障碍：木耳具有抗凝血的作用，因此有出血倾向或凝血机制障碍的人应避免食用木耳，以防加重病情。
生木耳中含有光敏物质卟啉，食后经阳光照射可能发生日光性皮炎，应避免食用生木耳，确保木耳完全煮熟后再食用。如果将浸泡后的木耳放置在温度过高的环境中，可能会导致其变质并滋生有害细菌，因此应避免食用变质的木耳，以防食物中毒。