膝盖的核磁共振检查不痛苦。这种检查方法是一种无创的检查方式，没有任何疼痛。在检查过程中，患者只需要躺在检查床上，保持膝盖不动，机器会对膝盖进行扫描。
部分患者感觉磁共振检查膝盖痛苦，可能是因为机器的声音较大，核磁共振检查不像CT检查一样是没有声音的，它有较大的声音，对于这种情况可以使用耳塞进行缓解。另外，核磁共振检查的时间相对比较长，需要20-30分钟，这段时间内患者需要将膝盖保持在伸直的状态，而且不能动，这也会让部分患者感觉不舒服。
部分患者存在幽闭恐惧症，而核磁共振内部的空间比较小，加之噪音的影响，会使这部分患者感觉非常痛苦，甚至难以顺利检查。这部分患者可以在医生的指导下服用镇静催眠的药物，如阿普唑仑片、氯硝西泮片等药物，进入睡眠状态，从而平静、顺利的进行检查。
如果患者在检查过程中感到特别不适或疼痛，应该立即告知医生并停止检查。