花甲肉里面的黑色东西能吃。花甲肉里面的黑色东西通常是花甲的肠腺和海泥部分，在经过清洗将泥沙去除后即可正常食用。
花甲即花蛤，花甲的肠腺是花甲的消化道，花甲一般以海中的海藻、微生物为食，其中的黑色部分通常是花甲还未消化完全的食物残渣，以及部分代谢废物。可以通过清理将部分残渣去除，食用后也不会对身体造成影响。
此外，花甲生活在海中的泥沙中，因此难免会进入泥沙，所以打开后会有黑色物质。这些黑色的泥沙部分不能直接食用，需要经过处理，可以将花甲放入干净的水中，等待其吐沙干净即可。
花甲具有高蛋白、高微量元素、高铁、高钙、少脂肪的营养特点，其中的营养物质丰富，含有蛋白质、维生素、碳水化合物、钙、镁、铁、锌等多种人体必需的微量元素。
而且花甲氨基酸种类组成及其配比较为合理，能很好地被人体吸收消化，食用花甲之后，可以为自身提供多种营养物质。
在烹饪花甲的时候应该确保熟透，可以有效杀灭有害的细菌微生物，以减少诱发恶心、呕吐等胃肠不适的可能。