单边扁桃体发炎原因多样，细菌感染如乙型溶血性链球菌等可趁虚而入致炎症；病毒感染如鼻病毒等也可引发；周围器官炎症蔓延，像鼻腔、鼻窦或牙齿炎症波及，均可能造成单侧扁桃体的炎性病变。
1、细菌感染：最常见的是乙型溶血性链球菌感染，这种细菌可以在人体抵抗力下降时侵入一侧扁桃体隐窝，例如在过度疲劳、受凉后，人体防御机制减弱，细菌就容易大量繁殖，葡萄球菌、肺炎链球菌等也可能导致单边扁桃体发炎，这些细菌会在扁桃体内产生炎症反应，引起局部充血、肿胀，还会伴有疼痛。
2、病毒感染：如鼻病毒、腺病毒等，这些病毒可以通过飞沫传播或者接触传播进入人体，当病毒侵入一侧扁桃体时，会在细胞内进行复制，导致扁桃体黏膜受损，病毒感染后的扁桃体通常会先出现充血，随后可能会出现白色或黄色的点状渗出物，和细菌感染不同的是，病毒感染引起的炎症可能在人体自身免疫反应作用下逐渐减轻，但也可能会继发细菌感染而加重。
3、周围器官炎症蔓延：当一侧的鼻腔、鼻窦发生炎症时，炎症可能会蔓延至同侧扁桃体，例如鼻窦炎产生的脓性分泌物可能会倒流至咽部，刺激扁桃体，而且牙龈、牙齿的炎症也可能波及扁桃体，进而引起扁桃体发炎。
单边扁桃体发炎后，若及时针对病因治疗，多数患者预后良好，炎症可在数天至数周内消退，症状缓解，但若是未彻底治愈或反复感染，可能转为慢性扁桃体炎，导致扁桃体肿大、咽痛反复。
一边扁桃体发炎的日常注意事项
- 口腔卫生：养成良好的口腔清洁习惯，饭后用淡盐水漱口，淡盐水可杀菌消炎，减少口腔内细菌滋生，能有效缓解扁桃体的炎症，早晚正确刷牙，保持口腔清洁环境，防止细菌在扁桃体隐窝积聚引发感染加重。
- 休息与锻炼：保证充足的睡眠，每晚睡眠7-8小时，利于身体恢复，适度进行体育锻炼，如散步、瑜伽等，但要避免过度劳累，运动可增强体质，但运动强度过大可能导致身体疲劳，使抵抗力下降，不利于扁桃体炎的康复。