脑干出血最痛苦的阶段通常是在发病后的初期。脑干位于大脑的底部，是人体生命中枢所在，控制着呼吸、心跳、血压等重要的生命体征，同时还负责传导感觉和运动信息。当脑干出血时，这些重要的生理功能会受到严重影响。
脑干中的呼吸中枢对维持正常的呼吸节奏起着决定性作用，脑干出血可能直接压迫或损伤呼吸中枢，导致呼吸节律紊乱、呼吸减弱甚至呼吸停止。在发病初期，患者会突然感到呼吸困难，呼吸变得急促、费力，甚至出现喘息、窒息感。
由于呼吸功能受损，患者可能需要依靠呼吸机辅助呼吸，这进一步增加了身体的不适和心理压力。脑干还参与心血管功能的调节，出血可能影响心血管中枢，导致血压急剧波动、心律失常等情况。
患者在初期可能出现血压突然升高或降低，心跳过速或过缓。血压的剧烈波动会引起头痛、头晕、心慌等不适症状，严重时可能导致脑血管破裂或心脏功能衰竭。心律失常则可能使患者感到心悸、胸闷、胸痛等，增加了心脏负担和猝死的风险。
脑干出血常常会导致不同程度的意识障碍，从嗜睡、昏迷到深度昏迷不等。在发病初期，意识状态的急剧变化给患者带来巨大的心理冲击。患者可能在瞬间失去对周围环境的感知和认知能力，无法与家人和医护人员进行交流。
深度昏迷的患者完全失去了自主意识，对外界刺激毫无反应，生命体征也变得极不稳定，随时面临着生命危险。对于脑干出血患者，应该给予及时、有效的治疗和护理，尽可能地减轻患者的痛苦，提高生活质量。