扁桃体切除对人体有一定的伤害，主要包括免疫系统的影响、咽部不适感等，但通常这种伤害是有限的，且因人而异。
1、免疫系统的影响：扁桃体是身体的免疫器官之一，作为防御细菌和病毒的第一道防线，在儿童时期尤为重要。儿童时期摘除扁桃体可能会对免疫系统造成一定影响，使免疫力下降，增加感染的风险。但对于成年人，扁桃体的免疫功能相对减弱，摘除后对免疫系统的影响较小。
2、咽部不适感：扁桃体切除后咽后壁的淋巴组织或舌根的淋巴组织可能会代偿性地增生，弥补扁桃体缺失的功能，这种增生可能导致咽部出现异物感或不适感。手术形成的瘢痕，也可能在咽部吞咽时产生牵拉感，增加咽部的不适。
3、发音和共鸣的改变：扁桃体在发音和共鸣中也起到一定作用，部分患者在扁桃体切除后可能会发现发音有所改变，尤其是在进行声乐活动时。但是该改变并不是普遍存在的，且多数患者可以逐渐适应。
扁桃体切除后，还可能出现其他潜在的影响，如咽喉干燥、呛咳等，可能与扁桃体切除后咽部的结构和功能改变有关。扁桃体切除术虽然属于常规手术，但仍存在一定的手术风险，包括咽部黏膜损伤、味觉障碍、牙齿损伤以及大出血等。
术后避免剧烈运动，以防止出血或伤口裂开，术后保持口腔清洁，以防止感染，术后定期复查，以便医生观察伤口愈合情况并处理并发症。