临床上并没有霉菌用什么药最好这一说法。霉菌是真菌的一种，当出现霉菌感染，可以在医生指导下使用克霉唑片、制霉菌素片、硝酸咪康唑栓、氟康唑片、注射用两性霉素B等药物进行治疗。
1、克霉唑片
当体内酸碱失衡，糖负荷过高或免疫功能衰竭时，即可引起霉菌感染。出现此类情况后，可以在医生指导下服用克霉唑片进行治疗。此类药物为广谱抗真菌药物，对皮肤念珠菌属、隐球菌属、曲菌、藻菌以及皮肤癣菌等均有良好的抑制作用；
2、制霉菌素片
为多烯类抗真菌药，具广谱抗真菌作用，对念珠菌属的抗菌活性高，常可用于治疗消化道念珠菌病；
3、硝酸咪康唑栓
咪康唑通过抑制真菌麦角甾醇的生物合成，从而改变细胞膜脂质成分的组成，导致真菌的死亡，故对于治疗霉菌感染也有一定帮助；
4、氟康唑片
此类药物属咪唑类抗真菌药，对于念珠菌感染、新型隐球菌感染、糠秕马拉色菌、小孢子菌属、毛癣菌属、表皮癣菌属等真菌类感染均有一定的治疗作用；
5、注射用两性霉素B
适用于敏感真菌所致的深部真菌感染且病情呈进行性发展者，如败血症、心内膜炎、脑膜炎、肺部感染、尿路感染和眼内炎等，对于治疗霉菌感染也有一定好处。
建议患者在医生指导下合理用药，避免盲目延长用药时间或停止用药，以免导致霉菌感染反复。如果在用药期间出现任何不适，应及时前往医院就诊。