至灵胶囊和百令胶囊均属于中成药物，但是两者有明显区别，如规格不同、价格不同、成分不同、功效不同、常见副作用不同等，因此用药需要在医生指导下进行，避免自行盲目用药。
1、规格不同
至灵胶囊的常用规格为0.25g；而百令胶囊的常用规格为0.5g；
2、价格不同
至灵胶囊的成分比较简单，其价格相对便宜，一般在40-70元；而百令胶囊的药物成分比较多一些，其价格相对昂贵，一般在65-170元；
3、成分不同
至灵胶囊的主要成分是冬虫夏草；而百令胶囊的主要成分为发酵冬虫夏草菌粉，而且还有蔗糖、糊精等辅料；
4、功效不同
至灵胶囊可以起到补肺益肾的功效，可用于肺肾两虚所致的咳喘、浮肿等症，亦可用于各类肾病、慢性支气管哮喘、慢性肝炎及肿瘤的辅助治疗；百令胶囊的主要功效是补肺肾、益精气，可用于治疗肺肾两虚引起的病症外，还可治疗咯血、面目浮肿、夜尿清长等病症；
5、常见副作用不同
至灵胶囊常见的副作用有心慌、胸闷、心律失常等；百令胶囊的副作用主要是口干舌燥、食欲不振等。
需要注意的 是，在服用至灵胶囊或者百令胶囊时，均需要配合饮食护理，避免进食辛辣、油腻、生冷的食物，如麻辣烫、红烧肉、炸鸡、冰镇饮料等，以免不利于病情控制。