男科全套检查费用因检查项目不同而有所差异，一般费用可能在500-8000元左右。如果只进行一些基础的常规检查，费用则相对较低，可能在500-1500元左右；而若涉及到一些高端的检查项目，如肿瘤早筛套餐中的CTC循环肿瘤细胞检测等，价格则可能更高。
基础的体格检查，包括对男性外生殖器的视诊和触诊等，费用通常比较低，一般在几十元左右。实验室检查方面，血常规、尿常规通常各在20-50元左右，能帮助了解身体的基本状况以及泌尿系统是否有感染等问题。精液常规检查大概100-300元，可了解精液的质量、精子的活力等情况。前列腺液检查约30元左右，有助于判断是否存在前列腺炎。
性激素六项检查费用在300-800元，能反映男性内分泌功能，对诊断性腺功能减退等疾病有重要意义。如果要进行HIV、梅毒筛查，费用约120元左右，支原体、衣原体检测则需200-400元，染色体核型分析相对较贵，约1000元。
影像学检查中，阴囊超声价格在200-400元，可观察睾丸、附睾等的形态、大小等。前列腺经直肠超声300-600元，能更清晰地显示前列腺的结构。精囊CT、前列腺磁共振等检查，单部位通常在800-1500元左右。
器械和内镜检查一般在几百元到数千元不等。如尿动力检查，费用可能在几百元，可评估尿路的功能。膀胱镜、精囊镜检查因操作相对复杂，费用可能在1000元以上，且可能需要住院，会增加相应的住院费用。
特殊检查项目中，对于无精症患者进行的睾丸活检，费用在800-2000元左右。勃起功能障碍患者可能需要接受的夜间勃起监测，费用约1500-3000元。