世界卫生组织数据显示，正确且全程使用时，其预防感染的有效率可达85%-95%。从医学角度来看，安全套预防艾滋病的核心原理是物理阻隔，其防护效果需结合材质特性与使用规范综合判断。
艾滋病病毒主要通过精液、阴道分泌物等体液传播，合格安全套的乳胶或聚氨酯材质具有致密结构，可有效阻挡病毒穿透，切断病原体与黏膜的接触途径。
安全套的防护效能并非绝对，实际使用中的诸多因素会导致效果波动，部分使用者在性接触开始后才佩戴，忽视了前期前列腺液、阴道分泌物中可能存在的病毒；佩戴时未排出储精囊空气、用牙撕包装等操作，易造成微小破损。此外，油性润滑剂会腐蚀乳胶材质，尺寸不当引发的滑脱或破裂，都可能使防护屏障失效。
材质选择与保存条件对防护效果的影响常被忽视，天然羊肠膜安全套存在天然孔隙，无法有效阻隔HIV，而乳胶或聚氨酯材质的规范产品，其孔隙直径远小于病毒尺寸，实验室阻隔率可达99%以上。但安全套若长期处于高温潮湿环境，或超过保质期，乳胶会老化变脆，即便外观完好，也可能存在肉眼不可见的破损，显著降低防护能力。
性行为类型与个体健康状况同样关联风险高低，肛交时直肠黏膜脆弱，安全套破裂风险高于阴道性交；若生殖器存在炎症、湿疹等破损，或伴侣处于HIV急性感染期，即便规范使用安全套，微量病毒仍可能通过接触侵入。合并梅毒、疱疹等性病时，黏膜屏障受损，会进一步提升HIV的感染概率。