芹菜籽含有丰富的营养成分，在一定程度上具有降压降脂、润肠通便的功效，还可辅助预防心血管疾病。但芹菜籽食用不当会给人体带来一些副作用，如加重胃肠负担、过敏、口舌生疮等。
芹菜籽含有芹菜素和丰富的不饱和脂肪酸，可以扩张血管，降低血压，降低血液中的甘油三酯和胆固醇，因此适量食用可以起到辅助降压降脂的功效。芹菜籽还含有丰富的蛋白质、维生素、膳食纤维等营养成分，适量摄入可增强胃肠蠕动，促进食物的消化吸收，预防便秘。芹菜籽中富含叶酸，可促进血液循环，从而可辅助预防心脑血管疾病。此外，芹菜籽可能还具有消除寒湿闭阻、消肿散气、止痛等功效，药用时需在医生指导下服用。
但是芹菜籽不宜过量长期食用，长时间吃容易导致体内产生热邪，诱发口舌生疮。而且芹菜籽中膳食纤维含量高，一次性过量食用，反而会加重胃肠道负担，出现消化不良、腹泻、腹痛等不适。如果对芹菜籽过敏，食用后还可能诱发过敏反应，出现皮肤瘙痒、红肿等不适。一旦出现异常症状，有加重迹象或长时间不缓解，则需及时就医治疗。