亚麻籽油本身并不会致癌，相反，它富含对人体有益的营养成分，是一种健康的食用油。然而，在一些不当的储存、加工和食用方式下，亚麻籽油可能产生有害物，从而存在潜在的健康风险，但这并不意味着它本身具有致癌性。
亚麻籽油的主要成分是不饱和脂肪酸，其中α-亚麻酸含量尤为突出，它在人体内可以转化为DHA和EPA，对维持健康有一定的积极作用。从食材本身的特性来讲，这些天然的营养物质不仅无害，还能为人体提供诸多益处，与致癌物质没有关联。
但亚麻籽油易在光照、高温、氧气等条件影响下发生氧化酸败，当亚麻籽油储存不当，比如长期暴露在阳光下，或者放置在温度较高的环境中，其中的脂肪酸就会逐渐氧化，产生过氧化脂质等物质，不仅会让亚麻籽油的味道变差，营养价值降低，长期大量食用氧化酸败的亚麻籽油，可能会对健康产生影响，甚至增加细胞发生异常突变的可能性，进而与癌症的发生产生间接联系。
另外，亚麻籽油并不适合高温烹饪。它的烟点相对较低，若用它进行油炸、煎炒等高温烹饪，在高温作用下，油中的成分会发生复杂的化学反应，产生如丙烯酰胺等有害物。丙烯酰胺是一种在高温烹饪中常见的疑似致癌物，频繁食用含有大量此类物质的食物，会给健康带来隐患。