桥本亚甲炎在甲功正常时没有标准治疗方法，在甲状腺功能下降（甲减）后的最主要治疗方式就是服用甲状腺激素补充缺乏的激素。桥本亚甲炎以甲状腺弥漫性肿大为主要临床表现，好发于30-50岁的女性，发病逐年上升，严重影响患者身心健康。
1、甲状腺激素替代疗法：
当桥本亚甲炎患者出现甲状腺功能减退时，应遵医嘱使用甲状腺激素替代疗法，这种疗法通过口服合成甲状腺素药物，来补充体内缺乏的甲状腺激素，从而改善患者的症状，用药期间需定期检测甲状腺功能，根据检查结果调整用药剂量，以确保治疗效果。
2、抗甲状腺药物治疗：
患者甲状腺毒症期，在症状难以控制时可在医生的指导下应用小剂量抗甲状腺药物治疗。但通常需要根据甲状腺功能监测情况及时调整药物剂量或停药。口服抗甲状腺药物存在肝功能损伤、粒细胞缺乏等风险，规律监测肝功、血常规可提高临床用药的安全性。出现药物不良反应和毒副作用应及时告知医生，医生会采取相应治疗措施或者停药。
3、中医外治法：
包括针灸、熏洗、贴等，当患者甲状腺肿大明显或伴有结节时，可辨证选用中药外敷辅助治疗，当出现甲状腺功能异常时，可以配合针灸等辅助治疗。
目前尚无治愈和针对病因治疗的方法，治疗在于纠正甲状腺功能的异常，改善症状、抑制甲状腺肿大、改善免疫功能等。
桥本亚甲炎患者日常需要注意的方面
- 高盐和高脂饮食可能加重身体负担，不利于病情恢复。患者应减少含盐量高的食物摄入，如腌菜、咸鸭蛋等；同时减少含油脂食物摄入，如油条、肥肉等。
- 适度的身体活动可以提高整体健康状况，但应避免过度劳累，尤其是病情活跃期，患者可以选择低强度、长时间的有氧运动，如散步、慢跑、瑜伽、太极拳等。这些运动不仅能够促进血液循环，提高身体代谢水平，还能有效缓解压力，改善情绪状态。