嘉兴市妇幼保健院外科是为了优化配置全市卫生医疗资源，适应城市发展规划要求，方便老百姓诊疗需求而创立的。通过近年的建设，从全国各地和市内引进了一大批临床经验丰富、各具专长的专家。目前学科已具一定规模，下设肿瘤外科、微创外科、创伤急救外科、小儿新生儿外科、乳腺外科、泌尿外科、神经外科和骨科，其中小儿新生儿外科、肿瘤外科、微创外科、创伤急救外科、乳腺外科是医院重点发展、重点扶持的学科。大外科中的小儿新生儿外科，其新生儿重症监护中心目前是我市最大的围产儿抢救中心，也是嘉兴市站点临床学科；而小儿新生儿麻醉则由王立中博士领衔组建。以往，小儿新生儿外科是嘉兴的薄弱所在，市立三一医院正是在麻醉和监护的双支撑下才走在全市领先地位的。创伤急救外科，综合普外科、骨科、神经外科、胸外科、急诊科和ICU，突现综合优势。新医院的创伤急救环境、抢救流程、设备配置等参照国际先进医院要求建设，急诊科配备急诊手术室，急诊处置、术前检查、术前准备、手术及术后观察一条龙，为抢救生命争取第一时间。小儿新生儿外科除了治疗常见的小儿阑尾炎、小儿疝气、小儿精素睾丸鞘膜积液外，还实施新生儿的先天性小肠闭锁、先天性肛门闭锁、先天性幽门肥厚等手术；其中，B超下整复治疗小儿肠套叠成功率非常高，可以有效避免小孩开腹手术，避免小孩招受X射线。微创外科开展腔镜下的肝肿瘤切除、肾肿瘤切除、结直肠肿瘤切除、甲状腺切除、、胆总管切开探查取石、输尿管切开取石、脾切除、阑尾切除、疝修补术及大隐静脉交通支离断术等。其中二孔法胆囊切除术，创伤更小，更美观，省内领先。肿瘤外科开展头颈部、肝胆胰、胃肠、泌尿生殖系及各种软组织肿瘤的手术及合理化、规范化、个体化的综合治疗。