复旦大学附属华山医院神经外科1952年建科，是中国南方最早建立的神经外科，是WFNS，ACNS的培训中心、国家神经疾病医学中心（主体单位）、教育部国家重点学科、卫生部重点建设学科、国家临床重点专科、上海市领先学科、上海市神经外科临床医学中心、上海市神经外科急救中心、复旦大学“重中之重”建设学科。复旦大学神经外科研究所、上海市脑功能重塑和神经再生重点实验室的依托单位，拥有脑功能研究室、颅底外科和显微外科实验室、内镜临床实训中心、脑血流实验室、GMP实验室、细胞分子实验室、智慧诊疗实验室、光遗传实验室、中枢神经系统疾病生物样本库、电生理实验室等，与国外多个医学中心开展合作研究和学者互访。作为国内最主要的神经外科中心之一，在我国神经外科史上写下了我国第一例脑肿瘤手术、第一例脑动脉瘤夹闭术、第一例脑干内生型血管母细胞瘤切除术、第一例自体干细胞脑内移植治疗开放性颅脑外伤等多个第一。迄今为止共开展了逾20万例神经外科手术，在神经外科的临床医疗、科研和教学等方面始终处于国内外先进水平。1989和2002年连续被国家教委批准为国家重点学科，“211工程”一、二、三期建设学科，1991年以来连续5次成为卫生部重点建设临床学科，1995年成为上海市领先学科，2001年成为复旦大学“重中之重”建设学科，2001年成为“上海市神经外科临床医学中心”，2004年成为“上海市神经外科急救中心”，2011年成为“国家临床重点专科”“复旦大学神经外科研究所”，2013年成立“上海市垂体瘤研究中心”。2018年荣获年度上海市质量金奖，2021年获得全国脱贫攻坚先进集体称号，2021年4月成为国家神经疾病医学中心。由中国社科院健康业发展研究中心发布的“全国医院互联网影响力”评比结果，华山医院神经外科连续5年位列专业排行榜第一名，中国医院最佳专科排行榜连续多年位列第二名。科室现有医师170人，包括中国工程院院士1名，973首席科学家1人，国家杰出青年基金获得者2人，教育部长江学者3名，青年长江学者2名，入选国家万人计划2名、百千万人才工程计划1名；共有正教授36人，副教授42人，其中博士生导师19人，硕士生导师17人，形成了具有高学历、高临床和科研能力的完整人才梯队。现有核定床位近800张，现代化专业手术室40间，配备有3.0T术中核磁共振2台、复合手术室4间，术中移动CT、伽马刀、射波刀等国际一流的硬件设施，能全方位开展各类高难度神经外科手术，实现手术、放疗、化疗和功能康复的综合治疗。每年接诊大量来自全国各地与海外的患者，2023年门诊总量达150710人次，急诊13921人次。2023年华山医院神经外科临床治疗总数为34782例，神经外科手术总量为16226例，国考四级手术占比为85.23%。全年共进行血管造影7320例，血管内介入治疗2896例，神经放疗治疗例数为1762例，伽玛刀治疗例数为4880例，射波刀治疗例数为1698例。主要包括下列亚专科：脑血管病外科和介入、颅脑外伤和神经重症、胶质瘤、颅底外科、脊髓脊柱、垂体瘤和内镜、功能神经外科、小儿神经外科、神经肿瘤综合治疗（放、化疗、放射外科），并设有神经外科研究所。