急性化脓性骨髓炎选择抗生素需要有效、联合、足量、足疗程，按照这样的原则选择抗生素。根据血培养或者分泌物的培养和药敏试验，选择敏感抗生素，用药周期比较长，至少要持续4-7周。一般的情况下，早期住院治疗，通过静脉给药，静脉给药效果是比较确切的，静脉给药3周，经过治疗，病情比较稳定了，很多病人都该出院了。出院之后，改成口服抗生素，还要继续应用3周，等到体温正常，化验白细胞数、血沉、C-反应蛋白都恢复正常，并且症状和体征明显改善或者消失以后，得需要2周，才能停药。疗程也不是固定不变的，4-6周是在比较早期，早期诊断清楚开始治疗，通过保守治疗能治好的病人，这个疗程比较有意义，并且是以采取了比较有效的抗生素治疗，更有意义。通过药物治疗，没有效果，甚至病情加重，需要手术治疗。骨髓炎治疗并不是单纯用药，必要时还需要及时的手术治疗。

骨髓炎如果能够得到早期诊断，选择合适手术和抗生素进行治疗，可以取得良好效果。如果病程到慢性骨髓炎后，很难彻底根治，患者全身症状虽然消失，但骨内仍有一处或多处脓性物、感染性肉芽组织和死骨病灶，在许多年内可间断出现感染急性发作，休息和抗生素治疗常有效，根治一般需要彻底外科手术清创、无效腔处理，联合有效抗生素治疗。慢性骨髓炎病人往往合并多发疾病、免疫缺陷，治疗方法选择必须根据患者具体情况进行个体化评估，慢性骨髓炎有发生恶变风险，但发生率较低。

治疗骨髓炎的外用药，急性和慢性不同，急性骨髓炎外用药主要用拔毒生肌的金黄膏、双柏散、玉露膏等。肢体疼痛肿胀用固元膏以后疼痛会减轻，肿胀会消退。但是对于慢性骨髓炎，比如伤口、窦道，主要是用中药外洗熏洗，比如骨髓炎一号、骨髓炎二号等，中药熬制以后把病肢放到药液里面浸泡、熏洗，可以起到很好的效果，有些病人窦道可以愈合，不通过手术，通过拔毒生肌的中药可以愈合。慢性骨髓炎的病人肢体肿胀，血液流通不好，通过活血化瘀的中药，可以使病人肢体的肿胀消退。如果骨髓炎时间比较久，有瘢痕，色素沉着，比较灰暗，通过中药熏洗可以软化瘢痕，可以改善皮肤的条件。