慢性骨髓炎多由血源性骨髓炎、开放骨折或创伤演变而来。
非急性发作时表现为局部症状多而全身症状少，急性期全身症状表现为疼痛、寒战、发热、局部红肿热痛、流脓，相对静止期时好时坏、时轻时重。
急性发作约数月甚至数年才发作一次，体温可升高1℃-2℃，封闭的窦道口可开放排出大量脓液，有时甚至掉出死骨，窦道时而闭合、时而开放甚至长期不愈，体质下降时诱发急性发作。
多年的窦道比如20-40年窦道要警惕恶变，患肢增粗、变形、骨骼形状不规则、表面皮肤菲薄、颜色发暗、色素沉着有多处瘢痕，窦道周围有肉芽组织增生，常有脓液和死骨排出，长期反复发作，骨骼多次手术使得骨骼扭曲变形、增粗。
因肌肉挛缩出现邻近关节畸形，儿童往往因骨骺破坏而影响骨骼生长发育，使肢体出现短缩畸形。