南京医科大学第二附属医院中心实验室，有副主任医师1名。除了基本的实验设备外，还拥有PE2400基因扩增仪、冷冻高速离心机、超低温冰柜等先进的仪器设备，可进行分子生物学、细胞培养、酶免分析、生化等范围的检测。实验室建立了新的细胞因子――氧化氮的检测方法及在多种疾病重的作用研究。与临床科室合作开展了各种胰岛移植治疗糖尿病地研究及端粒酶在消化道肿瘤组织中表达测定研究。引进国外先进检测项目，开展了恶性肿瘤特异性生长因子的检测，提高了临床早期恶性肿瘤的筛查和诊断水平；同时还应用荧光定量PCR方法检测各种病原体DNA，提高了对乙肝、丙肝、结核、性病等感染性疾病诊断的准确性；细胞遗传室还开展了外周血染色体核型分析，对遗传性疾病的诊断和优生优育的咨询提供了科学的依据。