杭州市中医院肾内科始建于1986年，是国内中医院及浙江省内首批建立的肾脏病专科之一，是国家临床重点专科、国家中医药管理局重点学科及肾病重点专科协作组大组长单位、国家中医药管理局首批重点研究室、国家中医药管理局护理学重点专科培育项目（肾病护理方向）护理学协作组组长之一、国家区域中医肾病诊疗中心（华东）、浙江省区域肾脏病诊疗中心（浙北）、浙江省中医肾脏病研究中心、浙江省血液透析专科护士培训基地、浙江省及杭州市首批医学重点学科、杭州市医学高峰学科。2019年，杭州市卫生健康委正式批复在杭州市中医院肾内科建设的基础上，融合肾外，成立杭州市肾脏病医院，打造首家中西内外联合的肾脏泌尿系疾病诊治中心。目前肾内科下设门诊、病房、血液净化中心、实验研究室、肾脏病理中心。多年来在王永钧教授带领下，注重临床实践和中医及中西医结合治肾优势的发挥，凭借临床疗效和求实的理念享誉国内外。建立并应用IgA肾病的辨证创新体系，提高了临床疗效，在慢性肾功能衰竭、肾病综合征、糖尿病肾病、肾炎、肾功能不全、肾衰、痛风性肾病、膜性肾病等疾病的治疗上积累了丰富的临床经验。除辨证饮片施治，还有辨证护理及各项外治疗法，形成完整有效的急慢性肾脏病一体化诊疗。学科对临床有效验方—复方积雪草方进行了重点研究和开发，通过现代研究方法揭示了其多途径、多靶点的作用机制，目前已形成清毒胶囊、泄浊胶囊、排浊泄毒灌肠剂等一系列中药特色院内制剂，临床效果显著。目前武林、丁桥二院区共开放四个病区，185张床位，年服务病人20万余人次，区域外患者超过60%，临床、研究、服务综合实力名列全国中医院前茅。连续多年荣获全国中医院最佳临床型专科，2021年荣获中华中医药学会全国中医肾病学科影响力排名第一。血液净化中心：血液透析：是国内最早开展血液透析的中医院，经过三十多年的建设和发展，已成为集医疗、教学、科研、康复于一体的大型血液净化中心，是浙江省综合实力最强的透析中心之一。现存活最长的透析患者透龄33年，年抢救急危重症患者800多例、年完成CRRT治疗3万小时。2005年成为杭州市血液净化质控中心挂靠单位。2013年起成为浙江省血透专科护士培训基地。2018年被评为“浙江省血液透析质量检查优秀单位、浙江省腹膜透析质量检查优秀单位”。2019年被评为“2009-2019年度浙江省优秀专科护士培训基地”。2020年荣获“浙江省抗击新冠肺炎先进集体”。2021年荣获“全国巾帼文明岗”、“浙江省中医医疗机构院感PDCA竞赛银奖”。并凭借对疑难危重患者成功的抢救，连续两次荣获“杭州市卫生系统临床医疗成果一等奖”。腹膜透析：1989年开展腹膜透析治疗，设有独立的腹透门诊诊疗室和病房腹透治疗室，配备专职腹透医生和护士，建立了系统的门诊随访制度，规律性门诊随访病人400余人，腹透病人腹腔感染发生率控制在100月/人次以上，远低于全国平均水平，腹透平均诊疗时间为80月以上，远高于国内平均水平，每年退出率低于15%，定期随访率达到95%以上，透析质了处于国内领先水平。省内多次评选的“腹透之星”均在中心产生，多次评为浙江省腹膜透析质量检查优秀单位。肾病实验研究室：是国家中医药三级实验室和浙江省肾脏病防治技术研究重点实验室、浙江省中医药重点实验室，开展门类齐全的肾脏类疾病检验项目，配备电子显微镜、高内涵高通量筛选系统、流式细胞仪、荧光定量PCR仪等先进仪器设备，致力于肾脏疾病的中西医结合基础前沿研究。肾脏病理中心：为杭州市肾脏病理诊断中心，定期主办浙江省线上肾脏病理研讨会，为区域地市医院提供病理检测与会诊服务，对提升区域肾脏病理诊断技术水平及指导临床治疗均有重要意义。科室先后承担国家科技部、国家自然科学基金在内的各级各类科研项目200余项，创新了“风湿致肾病”理论，牵头制定了国家中医药管理局肾风（IgA肾病）诊疗方案和临床路径、中华中医药学会肾病综合征等行业标准和临床指南，并在全国推广。获国家、省、市科学技术进步一等奖在内的各项成果奖100余项。获得国家发明专利5项，主编专著11部。参研的项目“IgA肾病中西医结合证治规律与诊疗关键技术的创研及应用”荣获2016年国家科技进步一等奖，是杭州市医药卫生系统迄今所获最高奖项。2019年承担的项目荣获中医药国际贡献二等奖。