南京医科大学附属儿童医院耳鼻咽喉科为江苏省省级临床重点专科，科室辐射范围广泛，病员来自全国各地（包括西藏、新疆、内蒙、广东等20多省市自治区），年门急诊人次达20余万人次，出入院人8600人次，年手术8000余人次。科室现编制床位34张，临床医师23人，听力中心人员5人，喉镜室2人，人才梯队合理。医疗特色为儿童耳鼻咽喉科疾病诊治，科室重视亚专科建设，近年来逐渐发展为小儿耳科学、小儿鼻科学、小儿头颈外科、小儿咽喉及气道，小儿嗓音医学，以及睡眠医学等亚专业方向，耳科学在人工耳蜗植入和小耳畸形耳廓再造方面享有盛誉，是国家人工耳蜗植入定点医院，是国内规模较大的人工耳蜗植入中心之一，省内率先完成骨导助听器BAHA Attract植入。科室的其他关键技术小包括儿急症呼吸道疾病气管支气管异物、食管异物，小儿睡眠障碍疾病扁桃体腺样体肥大，儿童听力障碍诊断及干预，鼻内窥镜下鼻息肉切除、鼻窦开放、翼管神经（蝶腭神经、鼻后神经）阻断术治疗儿童过敏性鼻炎等鼻科手术，儿童喉气道狭窄、头颈手术如甲状舌骨囊肿、梨状窝瘘、鳃裂囊肿（瘘）手术等。科研为儿童耳聋发病机制研究，具有国内领先的儿童听力学科研能力，在耳聋及神经耳科学基础和临床研究方面做了大量的工作。在省内率先开展儿童听力障碍的系统诊断研究和耳聋基因诊断，同时带动了儿童各种感音神经性耳聋、传导性耳聋的诊断和治疗。主要研究方向和内容包括听神经病机制、人工耳蜗临床和基础研究、遗传性耳聋分子流行病学和家系的研究，这些研究工作得到多项国家、江苏省和南京市的基金资助。每年发表多篇SCI收录文章，主编人民卫生出版社专著“儿童人工耳蜗植入”，副主编人卫版专著“临床儿童耳鼻咽喉头颈外科学”。