汕头大学医学院第二附属医院微创外科，是医院的重点学科，是一个在崭新微创理念指导下的临床跨学科项目，是实践一切为了病人的微创诊疗的国际新医疗模式。中心的宗旨是“以患者为中心，以循证为依据，以微创为手段，为患者提供痛苦小、恢复快的高质量服务”。微创外科包括微创诊疗中心、微创高级病房、学术与培训中心，多学科共同参与、互相协作、资源共享，实现专业特长与优势技术互补，是顺应国际医学发展新趋势，按最先进水平建设的一个极具特色的微创品牌项目。目前，微创外科拥有国际先进的KarlStorz腹腔镜一体化手术室、全高清电子内窥镜、超声内镜、胶囊内镜、能量平台、超声吸引刀(CUSA)、超声刀、高能超声聚集刀等最新设备，医护人员微创临床经验丰富，已成为粤东地区提供微创技术诊疗的先驱。在陈耿臻教授的带领下，全面开展包括结直肠、上消化道、肝胆、乳腺、甲状腺、疝、血管等专业广泛的微创外科手术，同时开展无痛内镜、ERCP、内镜下肿瘤切除、内镜影像介入诊疗等高级内镜技术和腔镜内镜联合技术，致力为粤东地区病人提供最优质的微创医疗服务。依托本中心技术力量，汕头大学医学院微创外科研究所在汕头大学医学院第二附属医院成立。研究所旨在促进各学科微创项目的共同发展，推进技术创新，与国内外著名微创医学中心开展合作，举办国内、国际会议，以促进学术交流与发展，并提供微创教育培训和基础研究。科室团队主持承担国家和省部级科研课题10项、市厅级科研课题11项；在国内外学术期刊发表论文60多篇，其中发表SCI收录论文7篇、核心期刊20余篇；参编医学专著3本，其中陈耿臻教授参编“十二五”普通高等教育本科国家规划教材《外科学（第3版）》；荣获汕头市科技进步奖一等奖一项，汕头市科技进步奖二等奖一项；获国家专利7项，其中《人工肛门直肠假体》获国家发明专利。