上海市中医医院肿瘤科分为肿瘤一科、肿瘤二科、肿瘤三科、肿瘤五科。肿瘤一科：肿瘤一科是以呼吸系统肿瘤（肺癌）为优势病种，兼顾常见消化系统肿瘤、妇科肿瘤的防治，在享受政府特殊津贴李雁教授和田建辉教授的带领下，传承国医大师刘嘉湘治癌学术思想，聚焦肺癌复发转移的防治，包括癌前病变、放化疗的减毒增效、以及晚期姑息治疗等。科室倡导以人为本、形神并调、精准治癌，联合院内外专家团队，开展放疗、化疗、分子靶向治疗、生物免疫治疗、心理治疗、物理治疗（高强度聚焦超声刀、全身深部热疗）、微创治疗（射频消融）等多种治疗方式，并利用肺癌1号方、补血升白方、逐水方等特色中医方剂，融合运用中药内服、针灸、贴敷、熏洗等内、外治法，能有效防治肿瘤的复发转移，不断提高肿瘤患者的综合疗效。肿瘤二科：上海市中医医院肿瘤二科是以上消化道（胃癌、食管癌、口腔）、消化腺（肝癌、胰腺癌）为优势病种，同时对常见呼吸系统、妇科肿瘤等通过中药内外兼治、中医药与现代微创治疗技术（血管介入、射频消融、高强度聚焦超声刀）相结合、中西医结合全程干预（癌前病变干预、放化疗期间减毒增效、术后防复发转移、晚期姑息治疗），不断提高中医临床疗效，具备规范诊疗技术的中医肿瘤临床优势专科。上海市中医医院肿瘤三科是集临床、科研、教学为一体的多功能临床科室，是一个奋发向上、具有青春活力的科室，目前科室共有医生人员7人，其中主任医师2人、副主任医师2人、中级职称以上人员3人，具有合理优秀的人才梯队，其中博士2位，硕士4位。科主任侯风刚，医学博士，主任医师，教授，博导，博士后合作导师。肿瘤三科：肿瘤三科以消化道肿瘤为主要诊疗范畴，聚焦胃肠道和腹膜肿瘤的中西医结合诊疗。在侯风刚主任的带领下，科室与外科、消化、医技等多个科室和部门成立了胃肠肿瘤协作组，促进了多学科合作，极大地提高了胃肠的诊疗水平。目前科室拥有高强度聚焦超声刀治疗、全身微波热疗、热灌注化疗等治疗技术手段，开展了肿瘤化疗、肿瘤靶向和免疫抑制等治疗手段。同时，科室在中医特色治疗上也极具特色，创立了术藤方等系列特色方剂，开展了中药内服、针灸以及几十种中医药外治疗法，能有效防治术后复发转移，缓解病痛，延长患者生存期。科室时刻关注专业领域发展方向，围绕结直肠癌、腹膜转移瘤、胰胆和小肠肿瘤等重点病种建立了科研团队，将中医药特色治疗与现代医学技术相结合，并将研究成果运用于临床。目前科室拥有专利7项，教育部、上海市政府、中华医学会及中华中医药学会科技进步奖等7项。承担国家级项目6项，省部级项目项12项，发表学术论文160余篇，SCI论文27篇，影响因子（IF）超过105。在教学上，科室承担了上海中医药大学各项教学任务及本院本科生、研究生、留学生等在院学生的教学任务。近年来共培养本专业硕士、博士研究生30余名，其中海外留学生3名（来自美国、韩国、伊朗等）。肿瘤三科以满足患者的临床需求为宗旨，以“减轻患者痛苦，延长患者生存”的目标，不断提升团队的诊疗水平和服务方式，并高度注重精神文明建设，积极承担和参与社会的公益活动，对促进专科学科发展产生了积极而深远的影响。上海市中医医院肿瘤临床医学中心肿瘤五科是为了进一步更好地发挥中医特色优势进行肿瘤治疗而设立的独立科室，科室以乳腺癌为优势病种，治疗方法和手段全面覆盖乳腺癌从发病到围手术期体质调理、术后放化疗减毒增效、恢复期上肢水肿预防和治疗等全过程，充分发挥中医药特色，创立了一整套安全有效、副作用小的诊疗方案。肿瘤五科：肿瘤五科同时将甲状腺癌、子宫内膜癌、卵巢癌、宫颈癌等妇科肿瘤以及前列腺癌作为重要研究方向，结合中医药手段进行规范治疗以提高临床疗效。科室还擅长运用超声聚焦技术无创治疗前列腺癌及前列腺增生，改善男性患者排尿困难，对于应用超声聚焦刀技术无创治疗子宫肌瘤有着较为丰富的治疗经验和较好的临床疗效。科主任朱为康为首届上海市名中医朱瑞群先生之孙，自幼传承家学，科室依托朱氏内科的学术精髓，充分发挥传承与创新结合的独特优势，创立以朱氏协定方内服结合朱氏特色散结方局部敷贴、特定穴位三伏贴、激光针灸等多种手段治疗甲状腺结节、乳腺结节、肺磨玻璃结节等多种临床常见的癌前病变，取得了较好的临床疗效。