鄂尔多斯市中心医院检验科分为东胜部检验科、康巴什部检验科。东胜部检验科东胜部检验科是集医疗、教学、科研为一体的临床医技科室，下设临检、生化、免疫、微生物、分子生物、急诊六个专业组。检验科建筑面积1200平方米，其中检验区占900平方米，办公区占310平方米。目前，科室有专业技术人员43人，其中硕士研究生14人，大学本科及以上学历占比超过93%，中高级职称人员占比为58%。高素质的检验队伍保证了检验结果的准确性。检验科拥有先进的大型仪器50余台，开展的常规检验项目480多项。每年均参加国家卫健委临检中心和上海临检中心的室间质评，参加率达到了100%，合格率95%以上。2012年，科室被鄂尔多斯市卫生局评为鄂尔多斯市医疗卫生重点专科。2022年8月，实验室通过了中国合格评定国家认可委员会ISO 15189医学实验室质量和能力认可。近年来，检验科主持或参与了近10项课题，包括内蒙古自然科学基金面上课题3项，内蒙古自治区卫健委医疗卫生科研计划项目2项，鄂尔多斯市科技计划项目1项。科室还荣获内蒙古自治区科技进步三等奖1项，鄂尔多斯科技进步三等奖1项，内蒙古医学会科技进步奖二等奖1项。在国内外期刊发表论文80余篇，其中SCI收录3篇。此外、科室还承担内蒙古医科大学鄂尔多斯临床学院本科生诊断学教学任务以及鄂尔多斯应用技术学院医学检验本科生教学，并为下级医院检验人员提供进修学习的机会。同时，科室也是临床检验诊断学专业的规培基地，拥有2名硕士研究生导师，培养了硕士研究生7名。康巴什部检验科康巴什部检验科是为医、教、研和人体健康评估提供检验服务的业务科室，是一个管理科学、设施先进、技术精湛、专业设置齐全的医学实验中心。检验科面积2200余平方米，配置有领先的仪器设备，如罗氏生化免疫流水线；迈瑞MT8000临检流水线；希森美康全自动尿液分析流水线；生物梅里埃VITEK质谱系统等高精设备90余台。现有工作人员27人，主任医师2人，主任技师1人，副主任医师1人，副主任技师3人，硕士研究生导师1人，硕士研究生学历5人，人员结构合理。设有临床血液体液学、临床生物化学、临床免疫学、临床微生物学等亚专业，开展检验项目400余项，科室在血液病、自身免疫性疾病、微生物相关疾病实验室诊断中拥有先进的设备及优秀的人才储备。2022年3月8日检验科通过中国合格评定国家认可委员会（CNAS）的认可成为ISO15189质量认可体系的一员。检验科奉行“准确、公正、及时、满意”的质量方针，建立了质量目标和质量指标进行全程质量管理。认真执行工作程序，确保检验数据的准确、可靠。目前科室还承担内蒙古医科大学及包头医学院等多所医学院校的本科生、研究生、规培生的理论及实践教学任务，且承担多项国家级及省市级科研课，主编及参编专著多册。