莱菔子性平、味辛，归脾、肺、胃经，具有降气化痰、消食除胀的功效。现代药理研究发现，莱菔子还具有抗菌作用。
1、降气化痰
莱菔子入肺经，具有降气化痰、止咳平喘的功效，可用于治疗痰涎兼盛、咳嗽气喘等症。
2、消食除胀
莱菔子入脾、胃经，具有消食除胀的功效，可消食化积、消胀除满，常用于治疗食积不化兼脾胃气滞引起的腹胀腹满、嗳气吞酸、腹泻等症。
3、抗菌
莱菔子含抗菌物质，对葡萄球菌和大肠杆菌有显著抑制作用，对链球菌、肺炎球菌及多种皮肤真菌也有不同程度的抑制作用。
莱菔子可与其他中药配伍，加强其降气化痰、消食除胀的功效，如配伍六曲、山楂、麦芽等，以助其消食之力；配伍半夏、陈皮等，以增其降逆和胃之功；有湿者可加茯苓；有热者可加黄连、连翘；如果有脾虚现象，可加白术；与白芥子、苏子等配伍应用，可使下气化痰作用更加显著。但是均需在医师辨证下用药，不可盲目自行用药，以免出现不良后果。
此外，莱菔子易耗气，无食积、痰滞、气血虚弱者忌用；莱菔子不宜与人参、熟地黄、何首乌同用；生莱菔子有轻微毒性 ，能引起恶心等症状，故宜用炒菜菔子。