小孩个子矮小的原因可以归结为多个方面，主要的原因包括遗传因素、营养不良、内分泌问题、早熟等。
1、遗传因素：遗传因素是影响儿童身高的最重要因素之一。如果父母或其他近亲的身高较矮，孩子可能遗传了这种身高特点，从而导致身材矮小。
2、营养不良：营养不良是儿童生长发育过程中常见的问题。孩子在成长过程中，如果摄入的营养不能满足其生长发育的需要，特别是缺乏蛋白质、钙质、维生素等关键营养素，就可能导致身高增长受限。
3、内分泌问题：生长激素缺乏或其他激素失调是导致儿童身材矮小的常见原因。生长激素是促进骨骼生长和身高增加的关键因素，如果体内生长激素分泌不足，就会影响身高的增长。甲状腺功能低下也会影响儿童的生长发育。甲状腺激素对儿童的骨骼生长和神经系统发育都有重要作用，如果甲状腺功能低下，就会导致身材矮小、智力发育迟缓等问题。
4、早熟：孩子过早进入青春期可能导致骨骼过早闭合，从而限制身高的增长。早熟的孩子在青春期前可能身高正常或略高于同龄儿童，但进入青春期后身高增长迅速放缓，最终可能导致身材矮小。
需要注意，一些慢性疾病如心脏病、肾脏疾病、哮喘、消化系统疾病、血液疾病等，都可能影响儿童的生长发育，导致身材矮小。如果家长发现孩子身高明显低于同龄儿童，应及时就医，寻求专业医生的帮助和建议。医生会根据孩子的具体情况进行全面的检查和评估，确定导致身材矮小的原因，并制定相应的治疗方案。