办理健康证的机构主要有当地卫生局、城市疾病预防控制中心、职业卫生检查机构、妇幼保健院、医院等，办理前需进行相关体检。
健康证是指对食品、饮用水生产经营人员、直接从事化妆品生产的人员、公共场所直接为顾客服务的人员等按国家卫生法律、法规规定所进行的从业前、从业和就学期间的健康检查。健康证涉及的疾病为痢疾、伤寒、肺结核等传染病，通常需要一年进行一次检查。因此，健康证的办理需前往可进行以上疾病筛查的地方，如当地卫生局、城市疾病预防控制中心、职业卫生检查机构、妇幼保健院、医院等，然后进行缴费、体检。
健康证的体检项目主要包含一般检查、内外科检查、五官检查，以及肝功两项检查、胸片、大便志贺菌和沙门菌的培养等检查项目，有些地区或有些特殊岗位也会要求增加梅毒、艾滋病检测。
此外，在办理的时候需要提供相应的材料，并按照规定的流程进行，才能符合办理的规定。