囊肿取出囊壁是基于预防复发、减少并发症、明确诊断、美观和患者心理，以及安全性等多方面的考虑而进行的。
1、预防复发：囊肿的形成往往与囊壁的存在密切相关，囊壁是囊肿的组成部分，具有分泌功能，能够不断产生囊液，使囊肿逐渐增大。如果仅将囊肿内的液体抽出而不去除囊壁，囊肿很可能在一段时间后复发，为彻底治疗囊肿并防止其复发，取出囊壁是必要的。
2、减少并发症：囊肿如果持续增大，可能会压迫周围的组织和器官，导致疼痛、功能障碍甚至更严重的并发症，例如肝囊肿如果生长过大，可能会压迫肝脏和周围血管，影响肝脏的正常功能，取出囊壁可以有效减小囊肿的体积，从而减轻对周围组织的压迫，降低并发症的风险。
3、明确诊断：囊肿的性质可能并不明确，需要通过病理学检查来确诊，取出囊壁并进行病理学检查，可以为医生提供准确的诊断依据，有助于制定更加合理的治疗方案。
4、美观和患者心理：对于位于皮肤表面的囊肿，如皮脂腺囊肿或表皮样囊肿，外观可能影响患者的美观和自信心，取出囊壁并切除囊肿，可以恢复皮肤的正常外观，减轻患者的心理负担。
5、安全性考虑：随着囊肿的增大，内部的压力也会增加，可能导致囊壁变薄、易破裂。一旦囊壁破裂，囊液可能流出并引起感染或其他并发症。从安全性的角度出发，及时取出囊壁并处理囊肿是明智的选择。
需要由专业的医生在严格的医疗条件下进行，以确保患者的安全和治疗效果。术后初期应保证充分休息，避免剧烈活动，根据手术部位，医生可能会建议采取特定体位，如头部稍微抬高，以减少肿胀。