在临床上通常没有爱妈咪和合生元哪个好的说法。爱妈咪是指枯草杆菌二联活菌颗粒，合生元是指儿童益生菌冲剂，二者均为益生菌制剂，都有助于调节肠道功能，可以根据自身情况选择使用。
1、枯草杆菌二联活菌颗粒
为复方制剂，其主要组成成分为活菌冻干粉、屎肠球菌、枯草杆菌、维生素C、维生素B1、维生素B2、维生素B6、维生素B12、烟酰胺、乳酸钙、氧化锌等。通常适用于消化不良、食欲不振、营养不良、肠道菌群紊乱引起的腹泻、便秘、腹胀、肠道内异常发酵、肠炎，以及使用抗生素引起的肠黏膜损伤等症，一般对本品过敏者禁用；
2、儿童益生菌冲剂
主要原料为瑞士乳杆菌、两歧双歧杆菌、婴儿双歧杆菌、低聚果糖、麦芽糊精，有免疫调节作用，对于维护整个肠道的微生态平衡有一定的作用。
上述两类药物其中的活菌是肠道益生菌，各种维生素及锌、钙的加入量是根据每日人体摄取推荐量标准加入的，遵医嘱给宝宝服用一般都较为安全，所以家长不用过于担心。但也要严格遵医嘱停药，及时复查并观察宝宝的精神状态。