肌动蛋白和肌球蛋白是两种不同的蛋白质，区别在于定义不同、结构不同、组成成分不同、作用不同和检测方式不同等。
1、定义不同
肌动蛋白是一种与肌肉收缩密切相关的蛋白质，参与肌肉的收缩和运动。而肌球蛋白是一类与肌肉收缩有关的球状蛋白质，包括肌球蛋白I、肌球蛋白C和肌球蛋白T三种亚型；
2、结构不同
肌动蛋白是三个亚单位组成的复合物，包括肌动蛋白重链和肌动蛋白轻链。而肌球蛋白则由头部、颈部和尾部组成，形如豆芽状，由两条重链和多条轻链构成；
3、组成成分不同
肌动蛋白主要参与肌肉的收缩和运动，是肌肉纤维的重要成分，分为三种类型，即α肌动蛋白、β肌动蛋白和γ肌动蛋白。而肌球蛋白由6条脑链组成的纤维状蛋白质，在横纹肌中是构成粗肌丝的主要成分，由一系列腺苷三磷酸(ATP)依赖的马达蛋白组成，参与肌收缩和其他真核生物运动的过程；
4、作用不同
肌动参与细胞形态的维持运动、分裂、迁移、生长、物质运输、细胞间信息的传递等许多生理活动。肌球蛋白主要为肌肉收缩提供动力，纤丝滑动学说认为肌肉收缩是肌动蛋白细丝与肌球蛋白丝相互滑动的结果；
5、检测方式不同
肌动蛋白的检测通常通过免疫学方法，如酶联免疫吸附测定(ELISA)、免疫组织化学或免疫印迹等。目前血清游离肌球蛋白的测定仍然使用免疫学方法，包括放射免疫分析法和酶联免疫吸附测定。
如果肌动蛋白阳性，大多见于横纹肌肉瘤、成骨肉瘤、恶性纤维组织细胞瘤、星形细胞肿瘤。而肌球蛋白阳性，多见于多肌炎与硬化症的重叠综合征、多肌炎、弥散性硬化症患者等，建议及时咨询医生进一步检查，以明确具体原因。