4毫米的结石相对较小，处理方法需根据结石的位置、成分、患者身体状况等因素综合考虑，包括保守治疗观察、药物辅助排石、体外冲击波碎石等。
1、保守治疗观察：如果4毫米的结石没有引起明显的症状，且所在部位没有造成尿路梗阻，可先采取保守治疗并密切观察。患者需要增加饮水量，每天2000-3000毫升，促进尿液生成，冲刷泌尿系统，有可能使结石自行排出。同时定期进行超声检查，监测结石的位置和大小变化。
2、药物辅助排石：在增加饮水量的基础上，可在医生的指导下服用一些有助于排石的药物。如α受体阻滞剂，能松弛输尿管平滑肌，促进结石排出。还可服用一些具有溶石作用的药物，适用于尿酸结石或胱氨酸结石，可通过溶解结石成分，使结石变小，利于排出。
3、体外冲击波碎石：如果结石在保守治疗一段时间后没有排出，且引起了疼痛、血尿等症状，或者结石位于输尿管等狭窄部位，影响尿液排出，可考虑体外冲击波碎石。通过体外产生的冲击波聚焦于结石，将结石击碎成较小的颗粒，使其更容易随尿液排出体外。但该方法可能会导致肾周血肿、输尿管狭窄等并发症。
4、微创手术治疗：如果结石长期嵌顿在尿路，引起严重的梗阻、肾积水、感染，或者经过多次体外冲击波碎石治疗无效，就需要进行微创手术治疗。如输尿管镜碎石取石术、经皮肾镜碎石取石术等，通过内镜或穿刺建立通道，直接将结石击碎并取出。
此外，患者日常还需要根据结石的成分调整饮食，若是草酸钙结石患者，应减少菠菜、豆类、葡萄、茶叶等富含草酸食物的摄入。对于尿酸结石患者，应限制高嘌呤食物，如动物内脏、海鲜、肉汤等；若是胱氨酸结石，需减少富含蛋氨酸的食物，如肉类、蛋类、奶制品等。