核磁共振一般能够报销，但是具体报销的比例需要根据患者是否住院、医院等级，以及个人医保类型进行综合判断。
核磁共振是通过对强外磁场中的人体发射某种特定频率的射频脉冲，使人体中的氢质子受到激励而发生磁共振现象，具有组织分辨力高、多序列、多参数、多方位和多种功能检查等优势，能够敏感地发现病变并显示病变特征，有利于疾病的早期检出和诊断。
根据国家基本医疗保险诊疗项目范围规定，如核磁共振、CT、心脏及血管造影X线机、彩色多普勒仪等大型医疗设备的检查，相对费用低一些，检查的效果也比较好，能够满足诊疗检查的目的。
为了适当控制费用，保证满足基本医疗目的，加强职工费用意识，规定可以部分予以报销，但是也需自己承担一部分费用。
若患者就诊于大型三甲医院，且为门诊患者、异地医保报销，则报销的费用较少，自费部分较多。而对于当地地区医院就诊的患者，且为住院患者、本地职工医保，则报销的比例较大，自费部分较少，具体需要根据当地医保政策报销。