血清素主要是由大脑、胃、肠等器官分泌的。血清素又称5-羟色胺，是一种色氨酸催化形成的生物胺衍生物，是重要的神经递质，对自身调节起着重要作用。
血清素主要分布于两处，一是大脑血清素，主要合成于脑干，大脑产生的血清素占身体总量的5％左右，在大脑中，血清素是一种神经递质，可调节行为、学习、食欲以及维持葡萄糖稳态；二是外周血清素，占身体总量中的95％，产生于外周器官，如胃、肠，可作为外周激素发挥作用，在外周是强血管收缩剂和平滑肌收缩刺激剂，具有影响血管收缩、肠蠕动、原发性止血、肝修复、调控脂肪生成、促进骨骼肌糖酵解、调节炎症细胞因子的产生以及T细胞介导的免疫系统的控制等作用。
血清素是一种广泛分布于机体内的化合物，既是一种神经递质，又是一种炎症介质，在自身调节中发挥作用，参与睡眠、痛觉、体温等生理功能的调节，并与精神病、偏头痛等多种疾病的发病有关。
血清素分泌不足，常出现在由社会应激和环境因素导致的焦虑、抑郁患者身上，因此治疗焦虑症、抑郁症时，会用选择性血清素再摄取抑制剂，即SSRI类药物。此药物可以帮助患者找回健康大脑，有利于让正 常血清素再次占据大脑领地，使患者远离抑郁、焦虑。