乳果糖是一种人工合成的不吸收性双糖，被广泛用于治疗慢性功能性便秘。从营养学和人体生理节律的角度来看，早上空腹时服用乳果糖效果更佳。不仅能充分发挥乳果糖的渗透性泻药作用，促进排便，还能避免夜间频繁排便影响睡眠。
乳果糖在早上空腹时服用，能够使其药物成分快速进入肠道，充分发挥其渗透性泻药的作用。经过一夜的休息，肠道相对处于静止状态，此时服用乳果糖可以更好地刺激肠道蠕动，促进排便，另外早上服用乳果糖还能让药物在肠道内有足够的时间进行作用，以便在一天内相对规律地产生排便效果，避免夜间频繁排便影响睡眠。
此外早上服用乳果糖还便于观察药物的效果和可能出现的不良反应，乳果糖服用后，通常会在短期内发挥效果，需要频繁上厕所。如果在晚上服用，可能会影响睡眠质量，而早上服用则能及时发现并处理任何不适。
但也有观点认为晚上服用乳果糖可能有一定效果，乳果糖中的糖分含量高，有一定的渗透作用，可以降低肠道酸碱度，有利于防止肠道内肠液和食物中的水分被过度吸收，增加大便体积，刺激肠蠕动。晚上服用乳果糖，药物在肠道内停留时间较长，可起到较好的润肠通便作用。但需要注意，晚上服用后可能会出现轻微的腹痛和腹泻等症状，影响睡眠质量。
每个人的肠道功能和便秘情况不同，具体的服用时间还需根据个人情况，在医生的指导下进行调整。另外在服用乳果糖期间，还应保持良好的生活习惯和饮食习惯，如增加膳食纤维的摄入、多喝水、适度运动等，以更好地改善便秘状况。