对于大部分人群而言，适量或少量进食榴莲可能不会对人体产生较明显的危害。但对于少部分人群而言，可能会引起胃肠道不适、增加肥胖风险，甚至导致机体过敏。
1、引起胃肠道不适：榴莲中含有较多的膳食纤维和部分蛋白质、脂肪、碳水化合物、维生素C等营养成分，进食后可以为机体补充相应的营养成分并提供能量，同时能增加饱腹感、缓解饥饿感。但少部分人群如果进食过多，可能会加重胃肠道的消化负担，出现腹痛、腹胀、呕吐等症状。此外，虽然其中含有的膳食纤维可以促进胃肠蠕动，但其本身较难消化，如果进食过多可能会因为膳食纤维堆积在胃肠道内，增加便秘的概率；
2、增加肥胖风险：榴莲含有一定量的热量，如每100g榴莲约含有556千焦的热量，如果进食过多，并且在进食后没有进行运动消耗热量，则可能会因为热量摄入过多，使其转化成脂肪并堆积在体内。长此以往，可能会引起肥胖；
3、过敏：部分人群体质较特殊，可能会对榴莲过敏。进食后因为接触过敏原，使其产生特异性抗体，并造成变态反应，可能就会出现腹泻、皮肤瘙痒、嘴唇红肿等过敏症状。